Okulumuz 01.10.1969 tarihinde Niğde-Aksaray Helvadere Ortaokulu adı ile öğretime açılmıştır. Halka ait kiralık binalarda eğitim- öğretime devam ederken 1980-1981 Eğitim-Öğretim yılında 2. kanaat dönemi başında Milli Eğitim Bakanlığı tarafından yaptırılan yeni binasına taşınmıştır. 1984-1985 Eğitim-Öğretim Yılı başında Aksaray-Helvadere İlköğretim ismini alarak eğitim ve öğretime başlamıştır.
1987-1988 Eğitim-Öğretim Yılı başından itibaren Helvadere Lisesi de okulumuz bünyesinde aynı binada 27.09.1999 tarih ve 715/3098 sayılı valilik oluru ile ayrılana kadar eğitim-öğretime devam etmiştir.
Yukarıda belirtilen aynı onay ile Helvadere Atatürk İlköğretim Okulu, Helvadere İlköğretim Okulu binasına taşınmıştır. Böylece iki okul birleştirilmiştir. 25.10.1999 tarih ve 715/3372 sayı ile adı Helvadere Atatürk İlköğretim Okulu olarak değiştirilmiştir.
Kasım 2000 tarihinde okulumuzun yanına Milli Eğitim Bakanlığı´mız tarafından Ek Bina yapımına başlanmıştır. 28.05.2001 tarih ve 715/1390 sayılı onay ile okulumuz ek binası da eğitim-öğretime açılmıştır.
Helvadere Atatürk İlköğretim Okulu, 6750 m² arazisi üzerinde, 332 m²lik İki binası (Ana ve Ek Bina olmak üzere iki ayrı binadan) eğitim ve öğretim faaliyetlerine devam etmektedir.
Okulumuz adını Ulu Önder Atatürk ve bulunduğu Helvadere Kasabası´ndan almaktadır.